消化系统由消化道和消化腺组成。食物从口腔进入消化道，经过机械作用和化学分解后，可被蜈蚣吸收利用。消化道很简单，有一根直管从嘴到 *** 贯穿身体中央，嘴后面有一个扩大的咽，咽的收缩有利于吸吮食物。咽的消化道由前肠、中肠和后肠组成。前肠和后肠很短，但中肠很长。前肠主要起接收、运输和消化食物的作用。中肠是消化和吸收食物的主要场所，后肠负责粪便的形成及其运输到尾段 *** 排泄。消化腺是一对葡萄状的唾液腺，通过唾液腺导管在前肠开口。唾液腺能分泌含有消化酶的唾液，能滋润和初步分解食物。
2.呼吸系统
蜈蚣通过气管系统呼吸。气管是体壁内陷形成的弹性管状结构，壁上有甲壳素螺旋线，可以支撑气管，便于气体流通。气管有很多分支，分布在体壁的细胞和组织之间。气管两侧有与外界空气阀门相通的开口，是气管形成时留下的陷阱。蜈蚣有6对气孔，分别在第4节、第6节、第9节、第13节和第15节。其他结都退化了，只留下一点痕迹。每个阀门都与开启装置连接，从而可以打开和关闭阀门。打开后，气体可以畅通无阻地进出。关闭时，可防止体内水分蒸发和异物侵入。
3.循环系统
蜈蚣的循环系统是开管的，但比较发达。管状心脏贯穿躯干，被心包包裹。它从后向前进入头动脉，通向头部的各个器官。除了前背侧血管外，还有一对侧动脉环绕消化道，在消化道的腹侧表面汇入神经血管。这些血管分支进入血腔。除此之外，蜈蚣除了末端节段之外的每一节都有一对心孔，心孔是血液从血窦进入心脏的开口。
4.排泄系统
蜈蚣的排泄管是马氏管。它是一种无分支的盲管，出生于中肠和后肠的连接处。马氏管的盲端游离在血腔内，从血液中吸收代谢产生的废物，送入后肠。后肠重新吸收水分后，与粪便一起从 *** 排出。
5.神经系统
蜈蚣的神经系统与蚯蚓相似，属于链状神经系统。包括从神经分布到触角和眼睛的脑神经节。食管下神经节有两条神经连接，食管下神经节有神经连接大颌、两对小颌和颌足。之后每节有两条后腹神经索和一对神经节。每个节段中的愈合神经节也愈合，每对神经节向每个节段发出神经来调节身体的活动。
6.生殖系统
蜈蚣雌雄同体。蜈蚣生殖系统的性腺都在消化道的后侧，是单个的卵巢或精巢。它由一个生殖道即输卵管或输精管组成，然后分成两个，沿消化道下行，分别在雌雄生殖孔处开口。此外，还有两对连接生殖导管末端的附属性腺。雌蜈蚣有两个精囊，雄蜈蚣有两个精囊，都与输卵管和输精管的末端相连。雌蜈蚣在卵子成熟时充满体腔，分娩前的母体将 *** 储存在精囊内，使发育完全的卵子在排卵时与 *** 结合，作为受精卵排出体外。
